Ca structură a Universităţii „Dunărea de Jos" din Galaţi, CTT-UGAL funcţionează în subordinea Consiliului de administraţie, reprezentat prin prorectorul cu activitatea de cercetare, dezvoltare, inovare, relaţii interuniversitare şi mediul de afaceri.
CTT-UGAL colaborează cu toate facultăţile universităţii, departamentele, centrele de cercetare şi cu structura administrativă a instituţiei.
CTT-UGAL poate colabora cu orice partener din mediul de afaceri legal constituit, cu alte centre de transfer tehnologic, cu autorităţile publice, instituţiile publice şi cu alte autorităţi, instituţii şi organizaţii cu competenţe în realizarea proiectelor din fonduri structurale europene, precum şi cu entităţile similare din străinătate.